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AutoDock Vina 源码编译
Linux 下编译时去掉 Makefile 里对 Boost 的 -static，否则很容易链失败。
2026-09-05 · 科研软件
源码：ccsb-scripps/AutoDock-Vina。推荐从源码编译（支持最新优化）。
sudo dnf install boost-devel -y
git clone https://github.com/ccsb-scripps/AutoDock-Vina.git /opt/software/AutoDock-Vina
cd /opt/software/AutoDock-Vina/build/linux/release建议移除静态链接（-static）Boost 库配置，否则很容易链失败：
cp Makefile Makefile.bak
sed -i 's/C_PLATFORM=-static -pthread/C_PLATFORM=-pthread/' Makefile
make编挂了可以重新编译：
make clean一旦编译成功，当前目录会有 vina 和 vina_split：
ls -lh vina vina_split
./vina --help安装到系统路径（推荐）：
sudo cp vina vina_split /usr/local/bin/
vina
vina_split只需要这两个执行文件。原文写安装完成后可以把安装目录删掉：
# rm -rf /opt/software/AutoDock-Vina源码目录可留着方便以后重编，不必为了「干净」立刻删。