科研软件

2025.2 之后改用 CMake。toolchain 编完后，DBCSR 版本号对不上是常见坑。

CMake + MPI 编译。external 仓库下载失败时，残留目录会导致脚本跳过。

Rocky 9 要先开 CRB 才能装 OpenBLAS。常用 package 按需 yes-，不要默认 yes-all。

Allwmake 之后，simpleFoam 和 decomposePar 有时要单独 wmake。

官方源码 + CMake。GPU 版建议较新的 CUDA；CPU / GPU 的安装前缀不要抄串。

Intel / AMD 两套 makefile。并行编译要改 dependencies，OBJECTS_O1 需带上 symlib.o；作业里 ulimit -s unlimited。

Rocky 上常缺合格的 lsb_release；Gateway 监听、License 主机名和队列核数要按集群改。

授权安装包解压后配 g16root / GAUSS_SCRDIR。多用户共用时用系统组管权限。

源码走 CMake，GPU 建议 CUDA 12.x。AmberTools 可另用 conda 装一套做分析。

用官方 toolchain 编依赖，再 make ssmp / psmp。2026 起请看 CMake 那篇。

Linux 下编译时去掉 Makefile 里对 Boost 的 -static，否则很容易链失败。

官方包不带 GTK3 运行库。缺 libgtk-3.so.0 时先装发行版 GTK3，RHEL7 默认不够新。

指定 GCC / MPI 包装器，Boost 和 TinyXML 用系统库，避免第三方重复编崩。

先编 GA，再 CMake 编 OpenMolcas。必须指定 Intel MPI 的 Fortran/C/C++ 包装器，否则会落到 gfortran。

要最新 R 就走源码。RStudio Server 默认 8787，按内网策略放行，不要一上来关掉 SELinux。