Materials Studio 在 Linux 集群上的安装要点

Materials Studio 是 BIOVIA 商业软件。现场笔记写「安装包自行找」；公开站改成从官方授权渠道获取安装包与许可证，后面 ./install、改 hostname、配 Gateway 的步骤不变。版本以 2023 / 23.1 为例，目录按安装器默认的 /opt/BIOVIA/。

依赖

sudo yum config-manager --set-enabled devel
sudo yum -y install gcc gcc-c++ gcc-gfortran csh redhat-lsb-core httpd libnsl perl-English perl-core

Debian / Ubuntu：

sudo apt -y install gcc g++ gfortran csh lsb-core apache2 libnsl

Perl 异常时可重装发行版 perl 包：

sudo yum reinstall perl perl-*

Rocky 上安装器若认不出发行版，是缺少它期待的 lsb_release 输出。可放一个只打印信息的包装脚本（仅用于安装器探测；系统里已有发行版自带的 lsb_release 就不要覆盖）：

sudo tee /usr/bin/lsb_release >/dev/null <<'EOF'
#!/bin/bash
echo "LSB Version: 1.4"
echo "Distributor ID: Rocky"
echo "Description: Rocky Linux 9"
echo "Release: 9"
echo "Codename: n/a"
EOF
sudo chmod +x /usr/bin/lsb_release
lsb_release -a

安装与 License

cd MaterialsStudio2023/
./install

修改许可证文件里的 hostname，改成许可证服务器真实主机名，再拷到 LicensePack：

cp msi2023.lic /opt/BIOVIA/BIOVIA_LicensePack/Licenses

不要把别人的 .lic 改个名字就用。

Gateway 与 Slurm

核数按「每节点核数 × 节点数」填。现场一次是 nproc 看到 64 核、10 个节点，所以 cpucorestotal=640。你的集群数字不同就改掉，不要照抄 640：

cd /opt/BIOVIA/MaterialsStudio23.1/etc/Gateway
./config/configure
# 编辑 cpucorestotal=640   ← 按本集群重算

节点列表在 share/data/machines.LINUX，写成你的计算节点名：

vim /opt/BIOVIA/MaterialsStudio23.1/share/data/machines.LINUX

队列：

./config/configure queue -queuepath SLURM/dsd_slurm -activate

23.x 需要改监听（20 不用）。原文把 Listen 127.0.0.1:18888 改成 Listen 0.0.0.0:18888，是为了计算节点能连上 Gateway。只在内网需要时改；对公网不要这样暴露，改成内网接口或指定 IP 更稳：

vim /opt/BIOVIA/MaterialsStudio23.1/etc/Gateway/configurations/default/conf/gwport.conf

export PATH=/opt/BIOVIA/MaterialsStudio23.1/etc/Gateway:${PATH}
export PATH=/opt/BIOVIA/MaterialsStudio23.1/bin:${PATH}
source ~/.bashrc
gwusers -add "$USER"

密码必须包含大小写、数字、特殊字符，且至少 8 位。查看：gwusers -list。更新：gwusers -update gatekeeper。

原文安装时关过 firewalld / SELinux。公开笔记把这两条留在这里当「现场曾经这样做」，不要当默认步骤：先按端口放行 Gateway，SELinux 拦住再查 audit。需要时再：

sudo systemctl disable firewalld --now
sudo setenforce 0
sudo sed -i 's/^SELINUX=.*/SELINUX=disabled/' /etc/selinux/config

手动启动网关：

su - biovia -c "/opt/BIOVIA/MaterialsStudio23.1/etc/Gateway/gwrestart"

需要开机自启时，用 systemd 调官方 start/stop 脚本，User 用安装时的服务账户。