技术文章
HPC / 集群
仅列出该分类下已发布的技术文章。
- CP2K 2026.1 安装（CMake）
2025.2 之后改用 CMake。toolchain 编完后，DBCSR 版本号对不上是常见坑。
- Quantum ESPRESSO 7.4.1 安装
CMake + MPI 编译。external 仓库下载失败时，残留目录会导致脚本跳过。
- LAMMPS 22Jul2025 安装
Rocky 9 要先开 CRB 才能装 OpenBLAS。常用 package 按需 yes-，不要默认 yes-all。
- OpenFOAM v2012 安装
Allwmake 之后，simpleFoam 和 decomposePar 有时要单独 wmake。
- GROMACS 2025 安装
官方源码 + CMake。GPU 版建议较新的 CUDA；CPU / GPU 的安装前缀不要抄串。
- VASP 6.4.2 编译与作业提交
Intel / AMD 两套 makefile。并行编译要改 dependencies，OBJECTS_O1 需带上 symlib.o；作业里 ulimit -s unlimited。
- Materials Studio 在 Linux 集群上的安装要点
Rocky 上常缺合格的 lsb_release；Gateway 监听、License 主机名和队列核数要按集群改。
- Gaussian 16 与 GaussView 环境
授权安装包解压后配 g16root / GAUSS_SCRDIR。多用户共用时用系统组管权限。
- Amber 24 / PMEMD 安装
源码走 CMake，GPU 建议 CUDA 12.x。AmberTools 可另用 conda 装一套做分析。
- CP2K 2025.1 安装（Makefile）
用官方 toolchain 编依赖，再 make ssmp / psmp。2026 起请看 CMake 那篇。
- Nektar++ 5.1 编译
指定 GCC / MPI 包装器，Boost 和 TinyXML 用系统库，避免第三方重复编崩。
- 用 OpenHPC 装 Slurm
管理节点装 slurm-server，计算节点装 slurm-client。slurm.conf 按本集群写，不要复制别人的主机名。